阿合奇县卫生健康委员会牢固树立大卫生、大健康理念,推动实施健康中国战略,以改革创新为动力,以促健康、转模式、强基层、重保障为着力点,把以治病为中心转变到以人民健康为中心,为人民群众提供全方位全周期健康服务。

阿合奇县卫生健康委员会，为阿合奇县人民政府工作部门，正科级单位。内设办公室、综合业务股。阿合奇县卫生健康委员会核定行政编制5名（其中领导职数3名），参照编制7名（卫生监督所5名、计生协会2名），事业编制6名（老龄健康服务中心4名、卫生监督所2名）。

阿合奇县卫健委机关党支部党员33人（含退休党员），隶属于阿合奇县卫生工作委员会。阿合奇县卫生工作委员会委员132人（女党员75人，少数民族党员62人，大专及以上学历党员92人）；下辖1个党委、7个党支部，分别为阿合奇县人民医院党委、阿合奇县卫健委党支部、阿合奇县疾控预防控制中心党支部、阿合奇县妇幼保健站党支部、阿合奇县红十字会党支部、阿合奇县人民医院行政后勤联合党支部、阿合奇县人民医院门诊内科联合党支部、阿合奇县人民医院外妇科联合党支部。2020年成立2个临时党支部，分别为阿合奇县疫情防控工作指挥部综合协调组临时党支部、阿合奇县应急避险中心临时党支部。

阿合奇县共有医疗卫生机构26个，其中医院1个、基层医疗卫生机构23个（社区卫生服务中心1个、乡（镇）卫生院6个、村卫生室16个）、专业公共卫生机构2个；卫生技术人员447名（其中县人民医院215人、村医54人），执业医师53人、执业助理医师53人、执业护士149人，床位270张。阿合奇县基本建立了由医院、基层医疗卫生机构、专业公共卫生机构等组成的覆盖城乡的医疗卫生服务体系。